Forschungsthema
Ribosomen katalysieren die Translation von mRNA in Proteine. Dadurch spielen sie eine Schlüsselrolle bei der Genexpression, dem Zellwachstum und dem Fortschreiten des Zellzyklus. Ribosomen sind gro?e Ribonukleo-Protein-Komplexe (RNP), die aus ribosomaler RNA (rRNA) und einer Vielzahl (>50) von ribosomalen Proteinen (r-Proteinen) bestehen. In den letzten Jahren wurden detaillierte Erkenntnisse über die 3D-Organisation von rRNA und r-Proteinen in ausgereiften Ribosomen gewonnen. Darüber hinaus wurde deutlich, dass ein erheblicher Teil des Genoms eines einzelligen Eukaryoten (B?ckerhefe S. cerevisiae) für Faktoren kodiert, die für die Herstellung von Ribosomen erforderlich sind. Anhand der Hefe als Modellsystem untersuchen wir mit verschiedenen In-vivo- und In-vitro-Ans?tzen die Zusammenh?nge zwischen wichtigen Prozessen der eukaryotischen Ribosomenbiogenese, n?mlich der RNA-Synthese, der RNA-Verarbeitung, der RNA-Faltung, dem RNP-Aufbau und dem intrazellul?ren Transport von RNP-Vorl?ufern.
Team
![]() | Joachim Griesenbeck, Principal investigatorE-Mail:? joachim.griesenbeck (at) ur.de |
![]() | Philipp Milkereit, Principal investigatorE-Mail:? philipp.milkereit (at) ur.de |
Catharina Schmid, DoktorandinE-Mail:? catharina.schmid (at) ur.de | |
![]() | Herbert Tschochner, Principal investigatorE-Mail:? herbert.tschochner (at) ur.de |
Publications
Selected publications
Griesenbeck, J., Tschochner, H., and Grohmann, D. (2017). Structure and Function of RNA Polymerases and the Transcription Machineries. Subcell. Biochem. 83, 225–270.
Pilsl, M., Crucifix, C., Papai, G., Krupp, F., Steinbauer, R., Griesenbeck, J., Milkereit, P., Tschochner, H., and Schultz, P. (2016b). Structure of the initiation-competent RNA polymerase I and its implication for transcription. Nat. Commun. 7, 12126.
Pilsl, M., Merkl, P.E., Milkereit, P., Griesenbeck, J., and Tschochner, H. (2016a). Analysis of S. cerevisiae RNA Polymerase I Transcription In Vitro. Methods Mol. Biol. Clifton NJ 1455, 99–108.
Merkl, P., Perez-Fernandez, J., Pilsl, M., Reiter, A., Williams, L., Gerber, J., B?hm, M., Deutzmann, R., Griesenbeck, J., Milkereit, P., and Tschochner H. (2014). Binding of the termination factor Nsi1 to its cognate DNA site is sufficient to terminate RNA polymerase I transcription in vitro and to induce termination in vivo. Mol. Cell. Biol. 34, 3817–3827.
Németh, A., Perez-Fernandez, J., Merkl, P., Hamperl, S., Gerber, J., Griesenbeck, J., and Tschochner, H. (2013). RNA polymerase I termination: Where is the end? Biochim. Biophys. Acta 1829, 306–317.
Reiter, A., Hamperl, S., Seitz, H., Merkl, P., Perez-Fernandez, J., Williams, L., Gerber, J., Németh, A., Léger, I., Gadal, O., Milkereit, P., Griesenbeck, J., and Tschochner, H. (2012). The Reb1-homologue Ydr026c/Nsi1 is required for efficient RNA polymerase I termination in yeast. EMBO J. 31, 3480–3493.
Reiter A, Steinbauer R, Philippi A, Gerber J, Tschochner H, Milkereit P, and Griesenbeck J. (2011). Reduction in Ribosomal Protein Synthesis Is Sufficient To Explain Major Effects on Ribosome Production after Short-Term TOR Inactivation in Saccharomyces cerevisiae. Mol Cell Biol. 2011 Feb;31(4):803-17.
Philippi, A., Steinbauer R., Reiter A., Fath S., Leger-Silvestre I., Milkereit P., Griesenbeck J. and Tschochner H. (2010) TOR-dependent reduction in the expression level of Rrn3p lowers the activity of the yeast RNA Pol I machinery, but does not account for the strong inhibition of rRNA production. Nucleic Acids Research, 2010, 38 (16), 5315-5326.
Reich, C., Zeller, M., Milkereit, P., Hausner, W., Cramer, P., Tschochner, H. and Thomm, M. (2009)? The archaeal RNA polymerase subunit P and the eukaryotic polymerase subunit Rpb12 are interchangeable in vivo and in vitro. Mol Microbiology 71, 989-1002.?
Clemente-Blanco, A., Mayán-Santos, M., Schneider, D.A., Machín, F., Jarmuz, A., Tschochner, H. and Aragón, L. (2009) Cdc14 inhibits transcription by RNA polymerase I during anaphase. Nature, 458, 219-222.?
Gerber, J., Reit